Blog week 8

Maandag 13 Oktober 2014 8:30 – 16:30

Administratie

Dinsdag 14 Oktober 2014 8:30 – 17:00

Ik ben de dag begonnen met het afronden van  administratie en een paar kleine voorbereidingen voor de middag. Toen s’ middags het droogijs geleverd was kon ik verder met de validatie aan de Bullit Blender. Voor vandaag stond er op de planning om met verschillende extractietijden te variëren. Nu is de extractie tijd namelijk een kwartier wat redelijk lang is. Na geëxperimenteerd te hebben met 6 en 12 minuten bleek dit niet gunstig voor een goede extractie. Na overleg hebben we vast gehouden aan de methode van een kwartier. Nu de laatste experimenten waren afgerond kon ik een begin maken aan de herhaalbaarheid. Dit wordt gedaan om vast te stellen hoe betrouwbaar de methode is. Aan de hand van meetresultaten van een aantal identieke monsters, wordt berekend wat het gemiddelde is en vervolgens word de spreiding bepaald (deze moet zo laag mogelijk zijn). Hierlangs zie je een screenshot van de validatie.

Woensdag 15 Oktober 2014 8:30 – 17:00

Vandaag ben ik verder gegaan aan de herhaalbaarheidsproeven voor de Bullit Blender. Eerst heb ik met de Braum (oude extractie apparaat) vergelijkingsgegevens verzameld. Na de lunch heb ik de herhaalbaarheidsproeven met de Westerschelde en Chlorella monsters uitgevoerd.

Donderdag 16 Oktober 2014 8:30 – 16:30

Vandaag ben ik de hele dag bezig geweest met monsters van het Oesterdam project. Deze heb ik een aantal weken geleden mee verzameld en moesten nog geanalyseerd worden. Het zijn in totaal 128 monsters dus voorlopig ben ik wel even zoet.

Vrijdag 17 Oktober 2014 9:00 – 16:00

Vandaag ben ik verder gegaan met de analyse aan de Oesterdam monsters. Hier ben ik de hele dag mee in de weer geweest. In de namiddag kwam Marco naar me toe om iets te bespreken. In de herhaalbaarheidsproeven eerder deze week was iets fout gegaan. De gemeten waardes voor de referentie vielen buiten de tolerantie. Ook op de HPLC (is veel preciezer dan de spectrofotometer en wordt in dit geval ter controle gebruikt) vielen de waardes lager uit. Er kon hiervoor eigenlijk maar een oorzaak zijn. Namelijk, als de monsters op de HPLC worden geanalyseerd wordt er gebruik gemaakt van aceton met een toevoeging (APO). Normaliter is dit geen probleem omdat dit niet uitslaat op de spectrofotometer. Na tests bleek de gebruikte aceton met toevoeging verkeerd aangemaakt. Hele opluchting voor mij ik was bang dat ik iets fout had gedaan. De rest van de dag heb ik de Oesterdam monsters geanalyseerd.

Blog week 7

Beste lezers deze week was een beetje een drukke week vandaar de late publicatie van mijn blog. Ik ben deze week bezig geweest met de validatie van de nieuwe extraheer machine (Bullit Blender). Om een duidelijk beeld te krijgen van de prestaties van het apparaat zijn er een aantal verschillende experimenten opgezet. In eerste instantie word er vergeleken welke Beads het meest geschikt zijn. Vervolgens is er gekeken naar de hoeveelheid tractie vloeistof (de vloeistof waarin je te analyseren materiaal wordt opgelost) Daarna zal geëxperimenteerd worden met verschillende draaitijden, dit is uiteindelijk opgeschoven naar volgende week.

Maandag 6 Oktober 2014 8:30 – 16:30

Ik ben vandaag begonnen met het aanpassen van mijn blog. Er was namelijk een kleine toevoeging vereist (zie einde blog week 6). Hierna ben ik samen met Marco de Chlorella cultuur gaan bekijken. Deze was op ons verzoek opgekweekt, omdat we deze nodig hebben voor de validatie van de BulletBlender. Waarom we Chlorella hebben gebruikt? Omdat dit een erg “harde” algensoort (sterke celwand) is en daardoor moeilijk te extraheren. Prima alg om te gebruiken in de validatie dus. De cultuur bleek in orde, dus kon ik voorbereidingen gaan treffen voor filtratie. Nadat alles klaargezet was ben ik eerst gaan pauzeren en heb daarna de filtratie gestart. Na afronding van de filtratie heb ik de filters opgeslagen in de -80oC vriezer. Na de middag zou ik eigenlijk een aantal zuurstof analyses uitvoeren. Dit ging helaas niet door vanwege bezette apparatuur, nou dan maar administratie.

Dinsdag 7 Oktober 2014 8:30 – 17:30

Vandaag zijn we begonnen met de validatie van de Bullit Blender. Als allereerste heb ik met de Braum Homogeniser (oude extractie apparaat) een referentie uitgezet van de verschillende monsters. In de middag ben ik samen met Marco aan de gang gegaan met de Bullit Blender. We moesten eerst even kijken hoe en wat omdat het een nieuw apparaat is. Na een korte verkenningsmissie om het zo maar te noemen zijn we begonnen met de verschillende experimenten. Bij de eerste 2 hebben we stalen kogels gebruikt met verschillende hoeveelheden tractie vloeistof. Een volgens eigen methode en een volgens advies van Next Advance (producent Bullit Blender). Vervolgens hebben we gekeken wat er gebeurd als onze eigen glasparels worden gebruikt. Uit deze experimenten kwamen een aantal bruikbare dingen naar voren, maar geen ideale waardes. Na opruimen en afronden heeft Marco mij op het station afgezet zodat ik mijn trein nog haalde.

Woensdag 8 Oktober 2014 9:00 – 18:00

Vandaag ben ik alleen verder gegaan met de validatie van de Bullit Blender. Op het programma stonden de

experimenten met zirkonium oxide. Deze zijn allemaal naar tevredenheid afgerond, echter de gevonden gehalten vielen voor Chlorella-cultuur lager uit in vergelijking met de glazen parels. De zirkonium beads zijn dus van tafel. Aan het einde van de dag heb ik een experiment herhaald, want dinsdag waren er een aantal reageerbuizen gebroken in de centrifuge. Voorlopig gaan we verder optimaliseren met de glasparels, want dit geeft tot op heden de meest belovende resultaten.

Donderdag 9 Oktober 2014 9:00 – 16:00

Vandaag weer verder gegaan met de validatie aan de Bullit Blender. Het is de bedoeling om met verschillende hoeveelheden glasparels te extraheren en te bepalen of dit invloed heeft op het rendement. Tijdens de voorbereidingen had ik een helder idee, namelijk een efficiëntere manier van werken. Tussen extractie en analyse worden de monsters gecentrifugeerd. Normaliter worden de monsters vanuit de extractie flesjes overgegoten in reageerbuizen en worden dan gecentrifugeerd. Bij de nieuwe extraheer machine worden andere flesjes gebruikt, in dit geval centrifugebuizen. Deze buizen kunnen na extractie rechtstreeks in de centrifuge worden ingevoerd. Althans als je de andere centrifugeer machine gebruikt. Maar voordat deze aan de praat was en werkte naar behoren was er flink wat tijd verloren. Voordelen ten opzichte van de oude methode: tijdswinst, minder kans op vervuiling en minder kans op verdamping. Later op de dag heb ik een aantal voorbereidingen voor vrijdag getroffen.

Vrijdag 10 oktober 2014 8:30 – 17:00

Vrijdag heb ik de laatste experimenten uitgevoerd. Na de eerste 2 experimenten waar werd gekeken naar verschillende volumes glasparels zag het er nog niet zo rooskleurig uit. Wederom waren de waardes voor Chlorella niet naar wens. Vervolgens hebben we gekeken wat er gebeurt als je de hoeveelheid extractievloeistof verminderd. Dit blijkt een positief effect te hebben. Waarschijnlijk vind er door het kleinere totaal volume meer contact plaats tussen monster en parels. Hierdoor verloopt de extractie beter. Nu zijn de waardes van Chlorella wel hoog genoeg. Yes! Great Succes! Na overleg en het opruimen van het laboratorium (het leek wel of er een veldslag had plaatsgevonden ofja op zijn minst was er één bom ontploft) ben ik welverdiend weekend gaan vieren. Volgende week ga ik verder met experimenteren, het is de bedoeling dat er dan wordt gekeken naar verschillende extractietijden. Misschien kan er in minder tijd hetzelfde resultaten worden geboekt. 

Nioz week 6

Maandag 29 september 2014

Ziek

Dinsdag 30 september 2014

Ziek

Woensdag 1 oktober2014 8:30 – 17:30

Woensdag ochtend heb ik eerst voorbereidingen getroffen voor monstername op donderdag. Er moesten een aantal dingen worden schoongemaakt en klaargezet. Rond 11 uur ben ik samen met Jeroen en een Engelse collega naar de Oesterdam geweest voor monstername. Samen met een team van Imares hebben we het wad bemonsterd. Er zijn die dag een aantal verschillende monsters genomen. Waaronder 2 maal de benthos eenmaal met een steekbuis  en een maal met een frame wat 5 cm diep wordt uitgegraven. Met het frame wordt er gekeken wat er in de bovenste laag aanwezig is, bemonstering met steekbuis gaat dieper. De oxidatielaag is gemeten en er zijn  monsters genomen voor grain size en pigmenten.  Er is ook een Arenicola (Zeepier) telling uitgevoerd. Heb hierbij gezien dat er erg grote verschillen zijn in het aantal wormen per m². Op sommige stukken zit niet eens één worm, en in gunstigere gebieden kunnen er wel 40 per m² voorkomen. In de dicht bevolkte gebieden zijn de wormen vaak wel kleiner, waarschijnlijk vanwege concurrentie  Van de laatste telling en de omgeving worden foto’s gemaakt. Na afloop van de werkzaamheden in het getijdengebied zijn we terug naar het Nioz gegaan om alle monsters te zuiveren en op te slaan.

Donderdag 2 oktober 2014 8:30 – 17:00

Vandaag stond er op de planning om een groot watermonster (circa 25L) te gaan halen bij Hansweert aan de Westerschelde. Dit monster wordt volgende week gebruikt om een test uit te voeren met de nieuwe BullitBlender. Dit is een apparaat dat wordt gebruikt voor extractie van pigmenten. Na terugkomst op het Nioz heb ik een aantal zaken voorbereid. Een hiervan was het bijvullen van het koelvat met vloeibare N₂ (stikstof). Best interessant om een keer te zien. Bij onverantwoord gebruik is het een zeer gevaarlijk middel, de extreme lage temperatuur (-196^oC!) kunnen bij contact met de huid namelijk brandwonden veroorzaken.

 Na de voorbereidingen en een boterham kon ik met filtratie beginnen. In het begin was het lastig omdat het monster in een jerrycan van 25 liter zat en dit is niet erg werkbaar zullen we maar zeggen. En voor betrouwbare testresultaten is het belangrijk dat er steeds met een homogeen mengsel gewerkt wordt. Na verloop van een aantal filters was het goed te doen. Na de filtratie worden de filters direct in het koelvat gedaan, de filters bevriezen direct (“flash freezing”). Als de filters niet onder de juiste omstandigheden worden opgeslagen gaat het fotosynthese proces gewoon door en dit beinvloed de meetresultaten. Na afloop zijn de filters opgeslagen in de -80^oC vriezer voor langere bewaartermijn.

Vrijdag 3 oktober 2014 9:00 - 14:00

Administratie.

Zaterdag 4 oktober 2014 11:00 - 13:00
Op zaterdag werd er in de Zeeuwse bibliotheek een wetenschapsdag georganiseerd. Dit is een jaarlijks terugkerend fenomeen waarbij kinderen van alle leeftijden geïntroduceerd worden in de wetenschap. Er zijn van allerlei leuke dingen te doen en te beleven voor de kinderen. Het Nioz was ook aanwezig

met twee stands. Bij de stand buiten konden kinderen hun eigen dijk bouwen van duplo en die vervolgens testen in een soort golfslagbad. Binnen werd het mossels en meeuwen spel gespeeld om de kinderen uit te leggen wat het natuurlijke gedrag is van mossels. Mossels hebben namelijk de neiging om groepjes te vormen. Zo worden ze minder snel opgegeten door bijv. meeuwen, het nadeel is dat mossels minder snel groeien als ze in zo'n groepje liggen. Maar er was een probleem er was geen vrijwilliger die zilvermeeuw wilde spelen. Ja jullie raden het al, ik kon weer geen nee zeggen. Al met al was het best leuk om te doen. Na afloop van mijn debuut als zilvermeeuw heb ik samen met mijn zusje nog een rondje gelopen om alles te bekijken. 

Verschillende punten voor monstername Oesterdam

Schaalmodel Luctor

Locatie Oesterdam bemonstering