Nioz week 5

Beste lezers deze week is de 5^de stage week bij het Nioz begonnen. Het is een beetje een korte week i.v.m. terugkomdagen van school. Deze vielen in het begin van de week. Op maandag heb ik een presentatie gegeven voor mijn mede leerlingen en visa versa. Op dinsdag hebben we met zijn allen samen een presentatie in elkaar gezet en deze hebben we in de avond voorgedragen aan onze ouders en aan de 1^e en 2^de jaars leerlingen. Het was leuk om iedereen weer een keer te zien en de meeste presentaties waren erg leerzaam. De rest van de week weer gewoon meegedraaid bij het Nioz.

Woensdag 24 September 2014 8:00 - 16:00

Vandaag ben ik samen met Lennart en Jeroen naar de Oesterdam bij Bergen Op Zoom geweest. Het doel was om een serie plots te openen en hiervan monsters te nemen. Na een aantal voorbereidingen konden we vertrekken. Er zijn op locatie verschillende monsters genomen en metingen uitgevoerd.

We zijn begonnen met het vrijmaken en opensnijden van de plots. Vervolgens heeft Lennart watermonsters genomen waarvan de sulfide concentratie moet worden bepaald. Er word een soort injectie naald in de grond geplaatst met een filtertje ervoor. Door de naald uit te trekken ontstaat er een onderdruk en wordt er water in de spuit gezogen het filtertje houdt ongewenst sediment tegen. De monsters worden op het lab met behulp van een ISE en een ORP electrode geanalyseerd. Deze berusten op het principe van potentiometrie, simpel gezegd wordt het potentiaal verschil in een stof gemeten, hieruit kan de concentratie van een stof worden afgeleid.  Jeroen heeft zich op de bentos gestort. Hierbij wordt er gekeken wat voor organismen groter dan 1mm er in en op de bodem voorkomen. De monsters worden op locatie gezeefd en het restant wordt naar het lab gebracht voor analyse. Tussen de bedrijven door is Jeroen bezig geweest met het maken van een 3 dimensionale scan van de omgeving (Riegl VZ400). Deze wordt later gebruikt en vergeleken met nieuwe scans om te kijken of en hoe de omgeving is verandert. In ons geval is vooral de hoogte van belang. Ik heb samen met Lennart gemeten waar de anoxische laag begint (laag waar geen zuurstof in zit) en er zijn  monsters genomen om de korrelgrootte te analyseren. Deze meting en monster worden in een keer genomen. Eerst wordt een PVC buis de grond in geslagen. Vervolgens wordt de buis omhoog gehaald en over de helft open gesneden. Nu kun je goed de verschillende lagen in de bodem zien. Met een duimstok wordt gemeten hoe diep de anoxische laag zit. Na het meten worden er 2 monsters genomen waarvan de korrelgrootte wordt bepaald. Op alle plots zijn 2

luminoforentegels geplaatst, (zie blog week 4) deze zijn op de hoeken gemarkeerd met stalen spijkers. Ook op de hoeken van alle plots zijn stalen spijkers geplaatst. Mocht het zo zijn dat de plots of tegels niet meer gevonden kunnen worden, dan zijn ze met behulp van een metaaldetector altijd nog te lokaliseren. Naast elk afzonderlijk plot is een controle plot uitgezet. Zo kunnen resultaten van de natuurlijke situatie vergeleken worden met de gedefauneerde plots. Na afloop van onze werkzaamheden op de Oesterdam zijn we terug naar het Nioz gegaan. Daar hebben we de watermonsters nog geanalyseerd op sulfide en de redox is bepaald.

Donderdag 25 September 2014 8:30 - 16:30

Voor vandaag stond er eigenlijk op de planning om weer naar de Oesterdam te gaan om de overige plots open te maken en te bemonsteren. Dit ging helaas niet door vanwege korte werktijden i.v.m. hoog en laag water. De desbetreffende locatie zou namelijk maar krap een uur droog komen te liggen en dit was niet lang genoeg om fatsoenlijk te kunnen werken. Dus ben ik aan de gang gegaan met mijn administratie en het opzoeken van een aantal termen met betrekking tot de monstername van gisteren. O.a. ion selectieve elektrodes en redox meting met ORP electrode. Na de kleine pauze was ik uitgenodigd voor het lab overleg. Was hier nog nooit bij geweest dus was interessant om een keer mee te maken. Het is vooral een moment voor laboranten en de lab verantwoordelijke om belangrijke dingen door te spreken. Dit kan variëren van aanschaf nieuwe apparatuur, tot problemen met de afzuiging van zuurkasten. Een van de besproken onderwerpen die voor mij van toepassing waren was de levering van een nieuwe kogelmolen (wordt gebruikt voor extractie). Voordat de kogelmolen volledig in gebruik kan worden genomen moeten er eerst een aantal onduidelijkheden worden opgelost. Er zijn namelijk een aantal verschillende kogels om in de molen te gebruiken, welke hiervan het meest geschikt zijn is nog niet duidelijk. Ook de draaitijd moet nog worden bepaald. Als de draaitijd te lang is krijg je te maken met verval (verlies van te analyseren materiaal). En al is de draaitijd te kort dan is de extractie nog niet voltooid en valt je meting lager uit. Dit vereist nog verder onderzoek dus. Na de middag heb ik mijn administratie op orde gebracht en nog een aantal dingen opgezocht.

Vrijdag 26 September 2014 8:30 -15:00

Normaal doe ik op vrijdag mijn administratie maar deze week was anders. Er kwam namelijk een studente ecologie naar het lab, zij had een aantal sedimentmonsters waarvan het chlorofyl gehalte van bepaald moest worden. Zelf had ze niet veel ervaring op het laboratorium dus was mij gevraagd om uitleg te geven. Het was prettig om met iemand van mijn eigen leeftijd samen te werken. Maar wel een beetje apart aangezien zij universitair geschoold is en ik mbo’er ben, en ik was diegene die uitleg gaf. Verder was het een korte dag. In de namiddag heb ik alvast opgeruimd en daarna vroeg uitgeklokt want ik ging dit weekend terug naar Brabant.

Nioz Week 4

Beste lezers, deze week is mijn 4de stageweek bij het NIOZ begonnen. Deze week was anders dan de afgelopen weken op het laboratorium. Ik ben vrijwel de hele week buiten aan het werk geweest: watermonsters nemen met een schip en voorbereidingen treffen voor het Oesterdam project.

Maandag 15 September 2014 8:30-16:30

Ik ben maandag begonnen met wat research betreft het Oesterdam project. Ik had van Lennart wat informatie over het project gekregen zodat ik mezelf kon inlezen. Alleen ik begreep niet alles wat er in de tekst stond dus heb ik eerst een aantal termen opgezocht. In de middag heb ik Lennart assistentie verleent in de werkplaats. Er moesten namelijk wat PVC buizen worden gezagen en geschuurd. Deze buizen worden gebruikt om het bodemprofiel zichtbaar te maken. Eerst worden ze in de grond geslagen, vervolgens worden ze open gesneden. Je krijgt dan een heel goed beeld van de bodemstructuur. 

Dinsdag 16 September 2014 7:30-14:30

Vandaag was een leuke en leerzame dag. Mocht namelijk mee gaan varen op De Luctor. Dit is een van de onderzoeksschepen van het NIOZ. Per maand vaart de Luctor een keer uit samen met personeel van het analytisch lab om water monsters te nemen op de Westerschelde. Op de eerste dag varen ze van Hansweert naar Antwerpen en terug, op dag 2 van Hansweert naar Vlissingen en terug. Onderweg zijn er een aantal meetlocaties zal de precieze locaties in mijn verslag verwerken, beschik nu nog niet over de coördinaten. Er wordt onder andere gemeten op nutriënten, zuurstof, CO₂ en zoutgraad. Met een grote NISKIN bottle van 10 liter word een monster genomen op vaste locaties, hiervan worden kleinere monsters genomen. Ook wordt het zeewater gefiltreerd (zie foto) voor de bepaling van onopgeloste deeltjes in het water of de aanwezige pigmenten. Tevens wordt een meetsonde (CTD) gebruikt: een apparaat met diverse sensoren die on-line kunnen analyseren zoals zout- en zuurstofgehalte, temperatuur, diepte enz. Een op het eerste gezicht simpele meting is de SECHI disk: een witte schijf wordt in het water gelaten en daarmee wordt de “doorzichtbaarheid”  van het water bepaald. Die is van belang voor het eerste leven in het water de zogenaamde “primaire produktie”. Hoe dieper de doorzichtbaarheid, des te meer licht kan er doordringen en des te meer leven is er mogelijk, mits andere condities zoals voeding ook goed zijn natuurlijk.

 Voor mij persoonlijk was het best bijzonder, ik had namelijk nog nooit op een schip gezeten. Ik heb verschrikkelijk veel gezien, geleerd en gefotografeerd:  zeehonden en collega’s zagen een bruinvis alleen die had ik net gemist. Tussen de verschillende meetpunten in heb ik de schipper lastig gevallen met vragen over zijn schip, stiekem nog veel geleerd. O ja in stuuRbooRd zit 2 maal de R zoals je ziet en dat is ook rechts, en dat maakt bakboord dan dus links. 

Woensdag 17 September2014 8:30-16:30

Ik ben de dag begonnen met het afronden van de werkzaamheden aan de PVC buizen (zie maandag). s ’Middags ben ik voor het Oesterdam project zandtegels met U.V. gevoelige kleurstof gaan maken. Deze tegeltjes worden eerst ingevroren en vervolgens op het wad geplaatst. Door de kleurstof is het mogelijk om het zand te traceren. Er zit een lang verhaal aan vast maar zal het proberen kort te omschrijven. Het wad is constant in beweging. Wormen woelen bijvoorbeeld de verschillende lagen door elkaar en stroming of golfslag heeft ook invloed. Hierdoor wordt een dagelijks een flinke hoeveelheid zand verplaatst, maar ja waar blijft het. Spoelt het weg de zee in of word het ergens anders in de schelde weer afgezet. Vragen die antwoord behoeven dus vandaar het traceerbare zand.

Donderdag 18 September 2014 9:00-17:00

Vandaag niet zo’n goede start. Had namelijk mijn trein gemist, balen! Maar ja dan maar wat langer door. Toen ik op stage aankwam ben ik eerst verder gegaan met het maken van zandtegeltjes. Was de vorige dag ongeveer tot de helft gekomen dus dat moest eerst afgerond worden. Na flink wat rugpijn en verdiende ingelaste pauzes met bakken koffie waren alle 106 tegeltjes gereed. Had nog anderhalf uur maar niet echt een klus. Nou ja dan maar administratie bijwerken en daarna naar huis.

Vrijdag 19 September 2014

Vandaag weer een administratieve dag. Blog en urenregistratie bijwerken en presentatie afronden.

Hieronder nog wat extra foto’s die ik op de Luctor heb gemaakt.

De brug

Radar

Layout schip

Uitzicht langs de stuurhut

Ja, dat zijn zeehonden!!

Week 3 NIOZ

Maandag 8 september 2014 8:30-16:30

Ik ben vandaag begonnen met opgeloste zuurstof analyses (Winkler O₂). Voordat deze uitgevoerd konden worden moest eerst de titer gesteld worden. Na het stellen van de titer ben ik de analyses gaan uitvoeren, het waren er maar 2 dus was zo gebeurd. Daarna een kalibratielijn (wordt ook wel ijklijn genoemd) geanalyseerd op de spectrofotometer. Dit wordt gebruikt ter referentie voor echte monsters. Dit nam nogal wat tijd in beslag omdat ik eerst niet begreep wat de bedoeling was. Na wat opheldering ging het een stuk beter en heb ik de kalibratielijn gemaakt. Het chlorofyl wat ik nodig had voor de kalibratielijn is opgeslagen in een vriezer die tot -82C^o koelt. Best leuk om een keer te zien. (er is hier dus altijd KOUD bier, had hier een paar foto's van maar krijg ze niet geüpload) Vervolgens ben ik een sediment monster gaan voorbereiden om morgen aan Hans te laten zien (stagebezoek). Aan het einde van de dag heb ik nog even zitten rommelen in Excel om mijn kalibratielijn goed in beeld te krijgen (zie foto onder).

Dinsdag 9 september 2014 8:30-16:30

In de ochtend in de weer geweest met verslag legging onderandere spectofotometrie en opgeloste zuurstof analyse. Hans kwam vandaag op stage bezoek en moest dus even wachten. Rond de middag was Hans er en die heeft eerst een rondleiding gehad over het instituut. Daarna zijn we samen in gesprek gegaan over leerdoelen en dergelijke. Aan leermomenten en punten zal ik hier geen tekortkomingen hebben. Er valt zo veel te zien en te leren. De rest van de dag ben ik met de spectrofotometer aan het werk geweest. Werk eigenlijk de hele dag samen met Jan. Jan analyseert dezelfde monsters als ik alleen dan met de HPLC. ( sorry mensen er komt even een technisch stukje)  Bij spectofotometrie wordt gebruik gemaakt van licht om een monster te analyseren. En wordt er gekeken/gemeten hoeveel licht van een bepaalde golflengte door het monster wordt geabsorbeerd (de zogenaaamde extinctie). Het probleem is alleen dat er ook stoffen zijn die op dezelfde golflengte ‘reageren’. De spectrofotometer geeft dit weer als één signaal terwijl het eigenlijk 2 of 3 afzonderlijke componenten zijn. Met een HPLC analyse is dit niet van toepassing. Bij HPLC wordt namelijk gebruik gemaakt van een scheidings techniek onder hoge druk (in dit geval ong. 180 bar) Alle afzonderlijke componenten worden zo van elkaar gescheiden en komen op verschillende momenten uit de kolom en kunnen vervolgens apart gemeten worden. Het is gebruikelijk dat de resultaten van de HPLC ongeveer 15-20% lager liggen dan die van de spectrofotometer.

Woensdag 10 september 2014 8:30 – 16:30

Ik ben begonnen om sediment monsters te vermalen ter voorbereiding voor HPLC en spectofotometrie analyses. Het zijn namelijk een beetje vaste klompjes en op die manier kan ik niet goed een monster inwegen.  Na vermalen heb ik de monsters geextraheert om het clorofyl in oplossing te brengen. En vervolgens door de centrifuge om alles weer te scheiden. gebeurt me geen 2^de keer.

Na voorbereidingen konden we de monsters gaan analyseren (zie foto rechts, eexcusesvoor de draaiing kreeg de foto niet goed) Eerst nam Jan een gedeelte van het monster om in te voeren in de HPLC, ik gebruikte de rest voor de spectrofotometer. Tijdens de analyse kwam naar voren dat er te veel chlorofyl aanwezig was in een aantal monsters om goede metingen te kunnen verrichten. Dit hebben we opgelost door desbetreffende monsters 1 op 1 te verdunnen met aceton. Hierdoor wordt de concentratie gehalveerd. Nu was analyse wel mogelijk. Ik had een klein foutje gemaakt gedurende de meting, waardoor het nog een keer moest worden uitgevoerd. Had namelijk de verkeerde aceton oplossing gebruikt er staan er 2 op het laboratorium 1 voor sediment monsters en een voor water monsters, ik had dus het verkeerde gebruikt. Maar ja van fouten leer je, dit

Donderdag 11 september 2014 8:30 – 16:30

Ik heb mijzelf donderdag administratief bezig gehouden er was weinig wat ik kon doen op het laboratorium. Er zijn problemen met de HPLC, dat moet eerst worden opgelost.  Heb eerst wat mails weg gestuurd en heb alvast een gedeelte van mijn blog getyped. Ondertussen nog wat info opgezocht over HPLC. Wat is dat nou, en wat doet ie? (Zie dindag 9 sept.)(theorie/techniek is eigenlijk veel ingewikkelder maar dat is het pricipe)

Vrijdag 12 september 2014 8:30 – 16:30

Verslaglegging en het in elkaar zetten van mijn presentatie voor de terugkomdagen want daar is volgende week geen tijd voor. Ik ben dan de hele week met YRE (Yerseke Ruimtelijke Ecologie) op pad en het is niet zeker dat ik dan tijd over heb voor de presentatie. Verder nog even mijn blog besproken met mijn stage begeleider. En mijn urenregisteatie is ook op orde gebracht.

Dat was het dan weer voor deze week. Hoop dat jullie allen hebben genoten van mijn text en uitleg. En tot volgende week. Hieronder nog wat interessante foto’s, nogmaals excuses voor de draaiing.

Week 2 Nioz

Maandag 1 September 2014 8:30-15:00

Vandaag de start van week 2 bij het Nioz. Ik ben begonnen met het aanmaken van nieuwe titreervloeistof voor de zuurstof bepaling nml. thiosulfaat. Vervolgens de titer bepaald, 5 maal i.p.v. 3 er was een te grote spreiding naar mijn zin. Na een kopje koffie het gemiddelde berekent en doorgevoerd in de software. Na de voorbereidingen kon ik nog wat zuurstof analyses uitvoeren, uiteindelijk 16 stuks. Na de middag ben ik wat research gaan doen op spectrofotometrie. Best interessant apparaat. Toen ik de basis principes begreep ben ik naar Jan gegaan, het was al wat later in de middag en dus te weinig tijd om de analyzer nog op te starten. Morgen vroeg eerste werk danmaar. In de namiddag heb ik mezelf nog even bezig gehouden, vroeg me af hoeveel water er elke dag de Oosterschelde in en uitstroomt ten gevolge van eb en vloed. Nou, dat is veel. Heb het grof berekend en kwam uit op 1.304.827.200.000 liter water. Dat is ruim een half miljoen zwembaden van olympische afmeting.

Dinsdag 2 September 2014 8:30-16:30

De dag begon met wat uitleg van Jan betreft spectrofotometrie. Dit is ook de analyzer waar ik de komende paar weken mee ga werken. In mijn geval word er gebruik gemaakt van zichtbaar licht

Kogelmolen

(Geen U.V. licht) om monsters te analyseren. Ben eigenlijk de hele dag met de spectrofotometer bezig geweest. Eerst een water monsters verzameld en gefilterd. Het residu en de filter vervolgens geëxtraheerd met aceton. Dit doen we door een monsterflesje in een kogelmolen (zie foto links) te plaatsen en vervolgens 20 seconden heel hard te laten schudden. Hierdoor wordt het filter met de aanwezige celwanden vernietigd en gaan de pigmenten in oplossing. Deze oplossing gaat vervolgens weer in de centrifuge. De vloeibare fractie wordt tenslotte geanalyseerd met de spectrometer. Dit gaat als volgt.
Een quarts kuvet wordt gevuld met de te analyseren oplossing en vervolgens wordt er een lichtstraal doorheen geleid. Doordat pigmenten licht opnemen, zal de intensiteit van het licht afnemen (op specifieke golflengte). Deze afnamen is een maat voor de concentratie van bijvoorbeeld chlorofyl-a.

Woensdag 3 September 2014 8:30-16:30

De dag begonnen met het verzamelen van watermonsters uit de schelde. Dit keer een groot monster van 1 Liter i.p.v. 10 maal 1 Liter. Dit vanwege uiteenlopende resultaten voorgaande dag. De monsters voorbereid voor analyse, filteren – vernietigen – centrifugeren en tenslotte analyseren. Voordat ik kon gaan analyseren moest eerst een blanco meting worden gedaan. Uiteindelijk net voor de pauze de analyses afgerond en daarna even opgeruimd. Zo alles weer netjes en nu??? Mijn begeleider had de rest van de dag vrij, dus kreeg ik een andere opdracht. Filters inwegen. Best saai klusje maar moest toch gebeuren. De filters worden gebruikt op onderzoeksschepen, weging is alleen niet mogelijk op zee vandaar dat het op het lab gebeurt.

Donderdag 4 September 2014

Eerst wat administratie moest namelijk even op collega wachten. Rond 9 ben ik in opdracht van Lennart (begeleider van andere afdeling) slib monsters gaan zeven. Een extern bedrijf wil graag weten wat de korrelgrootte is. Na het zeven, verzonden voor voorbehandeling. Na de middag ben ik de zandmonsters die vorige week op het wad zijn verzameld gaan zeven. Dit was best een taai klusje het waren namelijk 2 specie kuipen vol. Later word aan dit zand een kleurstof toegevoegd, vervolgens wordt het teruggebracht naar plaats van herkomst. Doordat de kleurstof is toegevoegd is het mogelijk om te zien waar het zand blijft, naartoe spoelt.

Vrijdag 5 September 2014

Door ziekte geveld.

Leerpunten: Haast en spoed zijn zelden goed. Moet er op letten dat ik rustig te werk ga kwaliteit staat ver boven kwantiteit.

Hieronder nog wat foto's.

Monster voor extractie.

Monster na extractie.

Gezeefde zand monsters.