Blog week 10

Maandag 3 November 2014 8:30- 16:30

Deze week een zeer korte blog. Ik ben bezig met de afronding van mijn stage. De werkzaamheden bestaan nu vooral uit verslagleggen. Verder staat er nog wel een overleg op de planning om de gegevens van de Oesterdam te bekijken en hier alvast een voorlopige conclusie aan te verbinden.  

Blog week 9

Blog week 9 NIOZ

Maandag 27 Oktober 2014 8:30 – 16:30

Vandaag ben ik verder gegaan aan de monsters van het Oesterdam project. Hier ben ik eigenlijk de hele dag mee in de weer geweest. Steeds inwegen, extraheren, centrifugeren en analyseren.

Dinsdag 28 oktober 2014 8:30 – 16:30

Ook vandaag weer verder met de Oesterdam monsters. In de ochtend zou Erik langskomen voor een stage bezoek. Hij was er rond 10 uur. Na alles besproken te hebben heb ik hem nog een rondleiding gegeven en is hij weer gegaan. De rest van de dag ben ik weer verder gegaan aan de Oesterdam analyses.

Woensdag 29 Oktober 2014 8:30 – 16:00

Wederom aan de gang met de Oesterdam monsters aan het einde van de dag had ik alles afgerond. Volgende week maandag ga ik met Lennart in overleg misschien kunnen er al een aantal bevindingen worden gedaan.

Donderdag 30 Oktober 2014 8:30 – 16:00

Vandaag ben ik bezig geweest met mijn verslaglegging en het afronden van een aantal administratieve zaken. Voor morgen en de laatste stage week staat ook verslaglegging op de planning.

Vrijdag 31 Oktober 2014 8:30 -  16:00

Vandaag weer een administratief dagje. Marco heeft me laten zien hoe je de gegevens van je analyses in LIMS moet zetten. Dat is een computer programma wat alle gegevens ordent en er voor zorgt dat de onderzoeker een melding krijgt dat zijn gegevens beschikbaar zijn. En dat hij ook alleen die dingen te zien krijgt die voor hem van toepassing zijn. 

Blog week 8

Maandag 13 Oktober 2014 8:30 – 16:30

Administratie

Dinsdag 14 Oktober 2014 8:30 – 17:00

Ik ben de dag begonnen met het afronden van  administratie en een paar kleine voorbereidingen voor de middag. Toen s’ middags het droogijs geleverd was kon ik verder met de validatie aan de Bullit Blender. Voor vandaag stond er op de planning om met verschillende extractietijden te variëren. Nu is de extractie tijd namelijk een kwartier wat redelijk lang is. Na geëxperimenteerd te hebben met 6 en 12 minuten bleek dit niet gunstig voor een goede extractie. Na overleg hebben we vast gehouden aan de methode van een kwartier. Nu de laatste experimenten waren afgerond kon ik een begin maken aan de herhaalbaarheid. Dit wordt gedaan om vast te stellen hoe betrouwbaar de methode is. Aan de hand van meetresultaten van een aantal identieke monsters, wordt berekend wat het gemiddelde is en vervolgens word de spreiding bepaald (deze moet zo laag mogelijk zijn). Hierlangs zie je een screenshot van de validatie.

Woensdag 15 Oktober 2014 8:30 – 17:00

Vandaag ben ik verder gegaan aan de herhaalbaarheidsproeven voor de Bullit Blender. Eerst heb ik met de Braum (oude extractie apparaat) vergelijkingsgegevens verzameld. Na de lunch heb ik de herhaalbaarheidsproeven met de Westerschelde en Chlorella monsters uitgevoerd.

Donderdag 16 Oktober 2014 8:30 – 16:30

Vandaag ben ik de hele dag bezig geweest met monsters van het Oesterdam project. Deze heb ik een aantal weken geleden mee verzameld en moesten nog geanalyseerd worden. Het zijn in totaal 128 monsters dus voorlopig ben ik wel even zoet.

Vrijdag 17 Oktober 2014 9:00 – 16:00

Vandaag ben ik verder gegaan met de analyse aan de Oesterdam monsters. Hier ben ik de hele dag mee in de weer geweest. In de namiddag kwam Marco naar me toe om iets te bespreken. In de herhaalbaarheidsproeven eerder deze week was iets fout gegaan. De gemeten waardes voor de referentie vielen buiten de tolerantie. Ook op de HPLC (is veel preciezer dan de spectrofotometer en wordt in dit geval ter controle gebruikt) vielen de waardes lager uit. Er kon hiervoor eigenlijk maar een oorzaak zijn. Namelijk, als de monsters op de HPLC worden geanalyseerd wordt er gebruik gemaakt van aceton met een toevoeging (APO). Normaliter is dit geen probleem omdat dit niet uitslaat op de spectrofotometer. Na tests bleek de gebruikte aceton met toevoeging verkeerd aangemaakt. Hele opluchting voor mij ik was bang dat ik iets fout had gedaan. De rest van de dag heb ik de Oesterdam monsters geanalyseerd.

Blog week 7

Beste lezers deze week was een beetje een drukke week vandaar de late publicatie van mijn blog. Ik ben deze week bezig geweest met de validatie van de nieuwe extraheer machine (Bullit Blender). Om een duidelijk beeld te krijgen van de prestaties van het apparaat zijn er een aantal verschillende experimenten opgezet. In eerste instantie word er vergeleken welke Beads het meest geschikt zijn. Vervolgens is er gekeken naar de hoeveelheid tractie vloeistof (de vloeistof waarin je te analyseren materiaal wordt opgelost) Daarna zal geëxperimenteerd worden met verschillende draaitijden, dit is uiteindelijk opgeschoven naar volgende week.

Maandag 6 Oktober 2014 8:30 – 16:30

Ik ben vandaag begonnen met het aanpassen van mijn blog. Er was namelijk een kleine toevoeging vereist (zie einde blog week 6). Hierna ben ik samen met Marco de Chlorella cultuur gaan bekijken. Deze was op ons verzoek opgekweekt, omdat we deze nodig hebben voor de validatie van de BulletBlender. Waarom we Chlorella hebben gebruikt? Omdat dit een erg “harde” algensoort (sterke celwand) is en daardoor moeilijk te extraheren. Prima alg om te gebruiken in de validatie dus. De cultuur bleek in orde, dus kon ik voorbereidingen gaan treffen voor filtratie. Nadat alles klaargezet was ben ik eerst gaan pauzeren en heb daarna de filtratie gestart. Na afronding van de filtratie heb ik de filters opgeslagen in de -80oC vriezer. Na de middag zou ik eigenlijk een aantal zuurstof analyses uitvoeren. Dit ging helaas niet door vanwege bezette apparatuur, nou dan maar administratie.

Dinsdag 7 Oktober 2014 8:30 – 17:30

Vandaag zijn we begonnen met de validatie van de Bullit Blender. Als allereerste heb ik met de Braum Homogeniser (oude extractie apparaat) een referentie uitgezet van de verschillende monsters. In de middag ben ik samen met Marco aan de gang gegaan met de Bullit Blender. We moesten eerst even kijken hoe en wat omdat het een nieuw apparaat is. Na een korte verkenningsmissie om het zo maar te noemen zijn we begonnen met de verschillende experimenten. Bij de eerste 2 hebben we stalen kogels gebruikt met verschillende hoeveelheden tractie vloeistof. Een volgens eigen methode en een volgens advies van Next Advance (producent Bullit Blender). Vervolgens hebben we gekeken wat er gebeurd als onze eigen glasparels worden gebruikt. Uit deze experimenten kwamen een aantal bruikbare dingen naar voren, maar geen ideale waardes. Na opruimen en afronden heeft Marco mij op het station afgezet zodat ik mijn trein nog haalde.

Woensdag 8 Oktober 2014 9:00 – 18:00

Vandaag ben ik alleen verder gegaan met de validatie van de Bullit Blender. Op het programma stonden de

experimenten met zirkonium oxide. Deze zijn allemaal naar tevredenheid afgerond, echter de gevonden gehalten vielen voor Chlorella-cultuur lager uit in vergelijking met de glazen parels. De zirkonium beads zijn dus van tafel. Aan het einde van de dag heb ik een experiment herhaald, want dinsdag waren er een aantal reageerbuizen gebroken in de centrifuge. Voorlopig gaan we verder optimaliseren met de glasparels, want dit geeft tot op heden de meest belovende resultaten.

Donderdag 9 Oktober 2014 9:00 – 16:00

Vandaag weer verder gegaan met de validatie aan de Bullit Blender. Het is de bedoeling om met verschillende hoeveelheden glasparels te extraheren en te bepalen of dit invloed heeft op het rendement. Tijdens de voorbereidingen had ik een helder idee, namelijk een efficiëntere manier van werken. Tussen extractie en analyse worden de monsters gecentrifugeerd. Normaliter worden de monsters vanuit de extractie flesjes overgegoten in reageerbuizen en worden dan gecentrifugeerd. Bij de nieuwe extraheer machine worden andere flesjes gebruikt, in dit geval centrifugebuizen. Deze buizen kunnen na extractie rechtstreeks in de centrifuge worden ingevoerd. Althans als je de andere centrifugeer machine gebruikt. Maar voordat deze aan de praat was en werkte naar behoren was er flink wat tijd verloren. Voordelen ten opzichte van de oude methode: tijdswinst, minder kans op vervuiling en minder kans op verdamping. Later op de dag heb ik een aantal voorbereidingen voor vrijdag getroffen.

Vrijdag 10 oktober 2014 8:30 – 17:00

Vrijdag heb ik de laatste experimenten uitgevoerd. Na de eerste 2 experimenten waar werd gekeken naar verschillende volumes glasparels zag het er nog niet zo rooskleurig uit. Wederom waren de waardes voor Chlorella niet naar wens. Vervolgens hebben we gekeken wat er gebeurt als je de hoeveelheid extractievloeistof verminderd. Dit blijkt een positief effect te hebben. Waarschijnlijk vind er door het kleinere totaal volume meer contact plaats tussen monster en parels. Hierdoor verloopt de extractie beter. Nu zijn de waardes van Chlorella wel hoog genoeg. Yes! Great Succes! Na overleg en het opruimen van het laboratorium (het leek wel of er een veldslag had plaatsgevonden ofja op zijn minst was er één bom ontploft) ben ik welverdiend weekend gaan vieren. Volgende week ga ik verder met experimenteren, het is de bedoeling dat er dan wordt gekeken naar verschillende extractietijden. Misschien kan er in minder tijd hetzelfde resultaten worden geboekt. 

Nioz week 6

Maandag 29 september 2014

Ziek

Dinsdag 30 september 2014

Ziek

Woensdag 1 oktober2014 8:30 – 17:30

Woensdag ochtend heb ik eerst voorbereidingen getroffen voor monstername op donderdag. Er moesten een aantal dingen worden schoongemaakt en klaargezet. Rond 11 uur ben ik samen met Jeroen en een Engelse collega naar de Oesterdam geweest voor monstername. Samen met een team van Imares hebben we het wad bemonsterd. Er zijn die dag een aantal verschillende monsters genomen. Waaronder 2 maal de benthos eenmaal met een steekbuis  en een maal met een frame wat 5 cm diep wordt uitgegraven. Met het frame wordt er gekeken wat er in de bovenste laag aanwezig is, bemonstering met steekbuis gaat dieper. De oxidatielaag is gemeten en er zijn  monsters genomen voor grain size en pigmenten.  Er is ook een Arenicola (Zeepier) telling uitgevoerd. Heb hierbij gezien dat er erg grote verschillen zijn in het aantal wormen per m². Op sommige stukken zit niet eens één worm, en in gunstigere gebieden kunnen er wel 40 per m² voorkomen. In de dicht bevolkte gebieden zijn de wormen vaak wel kleiner, waarschijnlijk vanwege concurrentie  Van de laatste telling en de omgeving worden foto’s gemaakt. Na afloop van de werkzaamheden in het getijdengebied zijn we terug naar het Nioz gegaan om alle monsters te zuiveren en op te slaan.

Donderdag 2 oktober 2014 8:30 – 17:00

Vandaag stond er op de planning om een groot watermonster (circa 25L) te gaan halen bij Hansweert aan de Westerschelde. Dit monster wordt volgende week gebruikt om een test uit te voeren met de nieuwe BullitBlender. Dit is een apparaat dat wordt gebruikt voor extractie van pigmenten. Na terugkomst op het Nioz heb ik een aantal zaken voorbereid. Een hiervan was het bijvullen van het koelvat met vloeibare N₂ (stikstof). Best interessant om een keer te zien. Bij onverantwoord gebruik is het een zeer gevaarlijk middel, de extreme lage temperatuur (-196^oC!) kunnen bij contact met de huid namelijk brandwonden veroorzaken.

 Na de voorbereidingen en een boterham kon ik met filtratie beginnen. In het begin was het lastig omdat het monster in een jerrycan van 25 liter zat en dit is niet erg werkbaar zullen we maar zeggen. En voor betrouwbare testresultaten is het belangrijk dat er steeds met een homogeen mengsel gewerkt wordt. Na verloop van een aantal filters was het goed te doen. Na de filtratie worden de filters direct in het koelvat gedaan, de filters bevriezen direct (“flash freezing”). Als de filters niet onder de juiste omstandigheden worden opgeslagen gaat het fotosynthese proces gewoon door en dit beinvloed de meetresultaten. Na afloop zijn de filters opgeslagen in de -80^oC vriezer voor langere bewaartermijn.

Vrijdag 3 oktober 2014 9:00 - 14:00

Administratie.

Zaterdag 4 oktober 2014 11:00 - 13:00
Op zaterdag werd er in de Zeeuwse bibliotheek een wetenschapsdag georganiseerd. Dit is een jaarlijks terugkerend fenomeen waarbij kinderen van alle leeftijden geïntroduceerd worden in de wetenschap. Er zijn van allerlei leuke dingen te doen en te beleven voor de kinderen. Het Nioz was ook aanwezig

met twee stands. Bij de stand buiten konden kinderen hun eigen dijk bouwen van duplo en die vervolgens testen in een soort golfslagbad. Binnen werd het mossels en meeuwen spel gespeeld om de kinderen uit te leggen wat het natuurlijke gedrag is van mossels. Mossels hebben namelijk de neiging om groepjes te vormen. Zo worden ze minder snel opgegeten door bijv. meeuwen, het nadeel is dat mossels minder snel groeien als ze in zo'n groepje liggen. Maar er was een probleem er was geen vrijwilliger die zilvermeeuw wilde spelen. Ja jullie raden het al, ik kon weer geen nee zeggen. Al met al was het best leuk om te doen. Na afloop van mijn debuut als zilvermeeuw heb ik samen met mijn zusje nog een rondje gelopen om alles te bekijken. 

Verschillende punten voor monstername Oesterdam

Schaalmodel Luctor

Locatie Oesterdam bemonstering

Nioz week 5

Beste lezers deze week is de 5^de stage week bij het Nioz begonnen. Het is een beetje een korte week i.v.m. terugkomdagen van school. Deze vielen in het begin van de week. Op maandag heb ik een presentatie gegeven voor mijn mede leerlingen en visa versa. Op dinsdag hebben we met zijn allen samen een presentatie in elkaar gezet en deze hebben we in de avond voorgedragen aan onze ouders en aan de 1^e en 2^de jaars leerlingen. Het was leuk om iedereen weer een keer te zien en de meeste presentaties waren erg leerzaam. De rest van de week weer gewoon meegedraaid bij het Nioz.

Woensdag 24 September 2014 8:00 - 16:00

Vandaag ben ik samen met Lennart en Jeroen naar de Oesterdam bij Bergen Op Zoom geweest. Het doel was om een serie plots te openen en hiervan monsters te nemen. Na een aantal voorbereidingen konden we vertrekken. Er zijn op locatie verschillende monsters genomen en metingen uitgevoerd.

We zijn begonnen met het vrijmaken en opensnijden van de plots. Vervolgens heeft Lennart watermonsters genomen waarvan de sulfide concentratie moet worden bepaald. Er word een soort injectie naald in de grond geplaatst met een filtertje ervoor. Door de naald uit te trekken ontstaat er een onderdruk en wordt er water in de spuit gezogen het filtertje houdt ongewenst sediment tegen. De monsters worden op het lab met behulp van een ISE en een ORP electrode geanalyseerd. Deze berusten op het principe van potentiometrie, simpel gezegd wordt het potentiaal verschil in een stof gemeten, hieruit kan de concentratie van een stof worden afgeleid.  Jeroen heeft zich op de bentos gestort. Hierbij wordt er gekeken wat voor organismen groter dan 1mm er in en op de bodem voorkomen. De monsters worden op locatie gezeefd en het restant wordt naar het lab gebracht voor analyse. Tussen de bedrijven door is Jeroen bezig geweest met het maken van een 3 dimensionale scan van de omgeving (Riegl VZ400). Deze wordt later gebruikt en vergeleken met nieuwe scans om te kijken of en hoe de omgeving is verandert. In ons geval is vooral de hoogte van belang. Ik heb samen met Lennart gemeten waar de anoxische laag begint (laag waar geen zuurstof in zit) en er zijn  monsters genomen om de korrelgrootte te analyseren. Deze meting en monster worden in een keer genomen. Eerst wordt een PVC buis de grond in geslagen. Vervolgens wordt de buis omhoog gehaald en over de helft open gesneden. Nu kun je goed de verschillende lagen in de bodem zien. Met een duimstok wordt gemeten hoe diep de anoxische laag zit. Na het meten worden er 2 monsters genomen waarvan de korrelgrootte wordt bepaald. Op alle plots zijn 2

luminoforentegels geplaatst, (zie blog week 4) deze zijn op de hoeken gemarkeerd met stalen spijkers. Ook op de hoeken van alle plots zijn stalen spijkers geplaatst. Mocht het zo zijn dat de plots of tegels niet meer gevonden kunnen worden, dan zijn ze met behulp van een metaaldetector altijd nog te lokaliseren. Naast elk afzonderlijk plot is een controle plot uitgezet. Zo kunnen resultaten van de natuurlijke situatie vergeleken worden met de gedefauneerde plots. Na afloop van onze werkzaamheden op de Oesterdam zijn we terug naar het Nioz gegaan. Daar hebben we de watermonsters nog geanalyseerd op sulfide en de redox is bepaald.

Donderdag 25 September 2014 8:30 - 16:30

Voor vandaag stond er eigenlijk op de planning om weer naar de Oesterdam te gaan om de overige plots open te maken en te bemonsteren. Dit ging helaas niet door vanwege korte werktijden i.v.m. hoog en laag water. De desbetreffende locatie zou namelijk maar krap een uur droog komen te liggen en dit was niet lang genoeg om fatsoenlijk te kunnen werken. Dus ben ik aan de gang gegaan met mijn administratie en het opzoeken van een aantal termen met betrekking tot de monstername van gisteren. O.a. ion selectieve elektrodes en redox meting met ORP electrode. Na de kleine pauze was ik uitgenodigd voor het lab overleg. Was hier nog nooit bij geweest dus was interessant om een keer mee te maken. Het is vooral een moment voor laboranten en de lab verantwoordelijke om belangrijke dingen door te spreken. Dit kan variëren van aanschaf nieuwe apparatuur, tot problemen met de afzuiging van zuurkasten. Een van de besproken onderwerpen die voor mij van toepassing waren was de levering van een nieuwe kogelmolen (wordt gebruikt voor extractie). Voordat de kogelmolen volledig in gebruik kan worden genomen moeten er eerst een aantal onduidelijkheden worden opgelost. Er zijn namelijk een aantal verschillende kogels om in de molen te gebruiken, welke hiervan het meest geschikt zijn is nog niet duidelijk. Ook de draaitijd moet nog worden bepaald. Als de draaitijd te lang is krijg je te maken met verval (verlies van te analyseren materiaal). En al is de draaitijd te kort dan is de extractie nog niet voltooid en valt je meting lager uit. Dit vereist nog verder onderzoek dus. Na de middag heb ik mijn administratie op orde gebracht en nog een aantal dingen opgezocht.

Vrijdag 26 September 2014 8:30 -15:00

Normaal doe ik op vrijdag mijn administratie maar deze week was anders. Er kwam namelijk een studente ecologie naar het lab, zij had een aantal sedimentmonsters waarvan het chlorofyl gehalte van bepaald moest worden. Zelf had ze niet veel ervaring op het laboratorium dus was mij gevraagd om uitleg te geven. Het was prettig om met iemand van mijn eigen leeftijd samen te werken. Maar wel een beetje apart aangezien zij universitair geschoold is en ik mbo’er ben, en ik was diegene die uitleg gaf. Verder was het een korte dag. In de namiddag heb ik alvast opgeruimd en daarna vroeg uitgeklokt want ik ging dit weekend terug naar Brabant.

Nioz Week 4

Beste lezers, deze week is mijn 4de stageweek bij het NIOZ begonnen. Deze week was anders dan de afgelopen weken op het laboratorium. Ik ben vrijwel de hele week buiten aan het werk geweest: watermonsters nemen met een schip en voorbereidingen treffen voor het Oesterdam project.

Maandag 15 September 2014 8:30-16:30

Ik ben maandag begonnen met wat research betreft het Oesterdam project. Ik had van Lennart wat informatie over het project gekregen zodat ik mezelf kon inlezen. Alleen ik begreep niet alles wat er in de tekst stond dus heb ik eerst een aantal termen opgezocht. In de middag heb ik Lennart assistentie verleent in de werkplaats. Er moesten namelijk wat PVC buizen worden gezagen en geschuurd. Deze buizen worden gebruikt om het bodemprofiel zichtbaar te maken. Eerst worden ze in de grond geslagen, vervolgens worden ze open gesneden. Je krijgt dan een heel goed beeld van de bodemstructuur. 

Dinsdag 16 September 2014 7:30-14:30

Vandaag was een leuke en leerzame dag. Mocht namelijk mee gaan varen op De Luctor. Dit is een van de onderzoeksschepen van het NIOZ. Per maand vaart de Luctor een keer uit samen met personeel van het analytisch lab om water monsters te nemen op de Westerschelde. Op de eerste dag varen ze van Hansweert naar Antwerpen en terug, op dag 2 van Hansweert naar Vlissingen en terug. Onderweg zijn er een aantal meetlocaties zal de precieze locaties in mijn verslag verwerken, beschik nu nog niet over de coördinaten. Er wordt onder andere gemeten op nutriënten, zuurstof, CO₂ en zoutgraad. Met een grote NISKIN bottle van 10 liter word een monster genomen op vaste locaties, hiervan worden kleinere monsters genomen. Ook wordt het zeewater gefiltreerd (zie foto) voor de bepaling van onopgeloste deeltjes in het water of de aanwezige pigmenten. Tevens wordt een meetsonde (CTD) gebruikt: een apparaat met diverse sensoren die on-line kunnen analyseren zoals zout- en zuurstofgehalte, temperatuur, diepte enz. Een op het eerste gezicht simpele meting is de SECHI disk: een witte schijf wordt in het water gelaten en daarmee wordt de “doorzichtbaarheid”  van het water bepaald. Die is van belang voor het eerste leven in het water de zogenaamde “primaire produktie”. Hoe dieper de doorzichtbaarheid, des te meer licht kan er doordringen en des te meer leven is er mogelijk, mits andere condities zoals voeding ook goed zijn natuurlijk.

 Voor mij persoonlijk was het best bijzonder, ik had namelijk nog nooit op een schip gezeten. Ik heb verschrikkelijk veel gezien, geleerd en gefotografeerd:  zeehonden en collega’s zagen een bruinvis alleen die had ik net gemist. Tussen de verschillende meetpunten in heb ik de schipper lastig gevallen met vragen over zijn schip, stiekem nog veel geleerd. O ja in stuuRbooRd zit 2 maal de R zoals je ziet en dat is ook rechts, en dat maakt bakboord dan dus links. 

Woensdag 17 September2014 8:30-16:30

Ik ben de dag begonnen met het afronden van de werkzaamheden aan de PVC buizen (zie maandag). s ’Middags ben ik voor het Oesterdam project zandtegels met U.V. gevoelige kleurstof gaan maken. Deze tegeltjes worden eerst ingevroren en vervolgens op het wad geplaatst. Door de kleurstof is het mogelijk om het zand te traceren. Er zit een lang verhaal aan vast maar zal het proberen kort te omschrijven. Het wad is constant in beweging. Wormen woelen bijvoorbeeld de verschillende lagen door elkaar en stroming of golfslag heeft ook invloed. Hierdoor wordt een dagelijks een flinke hoeveelheid zand verplaatst, maar ja waar blijft het. Spoelt het weg de zee in of word het ergens anders in de schelde weer afgezet. Vragen die antwoord behoeven dus vandaar het traceerbare zand.

Donderdag 18 September 2014 9:00-17:00

Vandaag niet zo’n goede start. Had namelijk mijn trein gemist, balen! Maar ja dan maar wat langer door. Toen ik op stage aankwam ben ik eerst verder gegaan met het maken van zandtegeltjes. Was de vorige dag ongeveer tot de helft gekomen dus dat moest eerst afgerond worden. Na flink wat rugpijn en verdiende ingelaste pauzes met bakken koffie waren alle 106 tegeltjes gereed. Had nog anderhalf uur maar niet echt een klus. Nou ja dan maar administratie bijwerken en daarna naar huis.

Vrijdag 19 September 2014

Vandaag weer een administratieve dag. Blog en urenregistratie bijwerken en presentatie afronden.

Hieronder nog wat extra foto’s die ik op de Luctor heb gemaakt.

De brug

Radar

Layout schip

Uitzicht langs de stuurhut

Ja, dat zijn zeehonden!!

Week 3 NIOZ

Maandag 8 september 2014 8:30-16:30

Ik ben vandaag begonnen met opgeloste zuurstof analyses (Winkler O₂). Voordat deze uitgevoerd konden worden moest eerst de titer gesteld worden. Na het stellen van de titer ben ik de analyses gaan uitvoeren, het waren er maar 2 dus was zo gebeurd. Daarna een kalibratielijn (wordt ook wel ijklijn genoemd) geanalyseerd op de spectrofotometer. Dit wordt gebruikt ter referentie voor echte monsters. Dit nam nogal wat tijd in beslag omdat ik eerst niet begreep wat de bedoeling was. Na wat opheldering ging het een stuk beter en heb ik de kalibratielijn gemaakt. Het chlorofyl wat ik nodig had voor de kalibratielijn is opgeslagen in een vriezer die tot -82C^o koelt. Best leuk om een keer te zien. (er is hier dus altijd KOUD bier, had hier een paar foto's van maar krijg ze niet geüpload) Vervolgens ben ik een sediment monster gaan voorbereiden om morgen aan Hans te laten zien (stagebezoek). Aan het einde van de dag heb ik nog even zitten rommelen in Excel om mijn kalibratielijn goed in beeld te krijgen (zie foto onder).

Dinsdag 9 september 2014 8:30-16:30

In de ochtend in de weer geweest met verslag legging onderandere spectofotometrie en opgeloste zuurstof analyse. Hans kwam vandaag op stage bezoek en moest dus even wachten. Rond de middag was Hans er en die heeft eerst een rondleiding gehad over het instituut. Daarna zijn we samen in gesprek gegaan over leerdoelen en dergelijke. Aan leermomenten en punten zal ik hier geen tekortkomingen hebben. Er valt zo veel te zien en te leren. De rest van de dag ben ik met de spectrofotometer aan het werk geweest. Werk eigenlijk de hele dag samen met Jan. Jan analyseert dezelfde monsters als ik alleen dan met de HPLC. ( sorry mensen er komt even een technisch stukje)  Bij spectofotometrie wordt gebruik gemaakt van licht om een monster te analyseren. En wordt er gekeken/gemeten hoeveel licht van een bepaalde golflengte door het monster wordt geabsorbeerd (de zogenaaamde extinctie). Het probleem is alleen dat er ook stoffen zijn die op dezelfde golflengte ‘reageren’. De spectrofotometer geeft dit weer als één signaal terwijl het eigenlijk 2 of 3 afzonderlijke componenten zijn. Met een HPLC analyse is dit niet van toepassing. Bij HPLC wordt namelijk gebruik gemaakt van een scheidings techniek onder hoge druk (in dit geval ong. 180 bar) Alle afzonderlijke componenten worden zo van elkaar gescheiden en komen op verschillende momenten uit de kolom en kunnen vervolgens apart gemeten worden. Het is gebruikelijk dat de resultaten van de HPLC ongeveer 15-20% lager liggen dan die van de spectrofotometer.

Woensdag 10 september 2014 8:30 – 16:30

Ik ben begonnen om sediment monsters te vermalen ter voorbereiding voor HPLC en spectofotometrie analyses. Het zijn namelijk een beetje vaste klompjes en op die manier kan ik niet goed een monster inwegen.  Na vermalen heb ik de monsters geextraheert om het clorofyl in oplossing te brengen. En vervolgens door de centrifuge om alles weer te scheiden. gebeurt me geen 2^de keer.

Na voorbereidingen konden we de monsters gaan analyseren (zie foto rechts, eexcusesvoor de draaiing kreeg de foto niet goed) Eerst nam Jan een gedeelte van het monster om in te voeren in de HPLC, ik gebruikte de rest voor de spectrofotometer. Tijdens de analyse kwam naar voren dat er te veel chlorofyl aanwezig was in een aantal monsters om goede metingen te kunnen verrichten. Dit hebben we opgelost door desbetreffende monsters 1 op 1 te verdunnen met aceton. Hierdoor wordt de concentratie gehalveerd. Nu was analyse wel mogelijk. Ik had een klein foutje gemaakt gedurende de meting, waardoor het nog een keer moest worden uitgevoerd. Had namelijk de verkeerde aceton oplossing gebruikt er staan er 2 op het laboratorium 1 voor sediment monsters en een voor water monsters, ik had dus het verkeerde gebruikt. Maar ja van fouten leer je, dit

Donderdag 11 september 2014 8:30 – 16:30

Ik heb mijzelf donderdag administratief bezig gehouden er was weinig wat ik kon doen op het laboratorium. Er zijn problemen met de HPLC, dat moet eerst worden opgelost.  Heb eerst wat mails weg gestuurd en heb alvast een gedeelte van mijn blog getyped. Ondertussen nog wat info opgezocht over HPLC. Wat is dat nou, en wat doet ie? (Zie dindag 9 sept.)(theorie/techniek is eigenlijk veel ingewikkelder maar dat is het pricipe)

Vrijdag 12 september 2014 8:30 – 16:30

Verslaglegging en het in elkaar zetten van mijn presentatie voor de terugkomdagen want daar is volgende week geen tijd voor. Ik ben dan de hele week met YRE (Yerseke Ruimtelijke Ecologie) op pad en het is niet zeker dat ik dan tijd over heb voor de presentatie. Verder nog even mijn blog besproken met mijn stage begeleider. En mijn urenregisteatie is ook op orde gebracht.

Dat was het dan weer voor deze week. Hoop dat jullie allen hebben genoten van mijn text en uitleg. En tot volgende week. Hieronder nog wat interessante foto’s, nogmaals excuses voor de draaiing.

Week 2 Nioz

Maandag 1 September 2014 8:30-15:00

Vandaag de start van week 2 bij het Nioz. Ik ben begonnen met het aanmaken van nieuwe titreervloeistof voor de zuurstof bepaling nml. thiosulfaat. Vervolgens de titer bepaald, 5 maal i.p.v. 3 er was een te grote spreiding naar mijn zin. Na een kopje koffie het gemiddelde berekent en doorgevoerd in de software. Na de voorbereidingen kon ik nog wat zuurstof analyses uitvoeren, uiteindelijk 16 stuks. Na de middag ben ik wat research gaan doen op spectrofotometrie. Best interessant apparaat. Toen ik de basis principes begreep ben ik naar Jan gegaan, het was al wat later in de middag en dus te weinig tijd om de analyzer nog op te starten. Morgen vroeg eerste werk danmaar. In de namiddag heb ik mezelf nog even bezig gehouden, vroeg me af hoeveel water er elke dag de Oosterschelde in en uitstroomt ten gevolge van eb en vloed. Nou, dat is veel. Heb het grof berekend en kwam uit op 1.304.827.200.000 liter water. Dat is ruim een half miljoen zwembaden van olympische afmeting.

Dinsdag 2 September 2014 8:30-16:30

De dag begon met wat uitleg van Jan betreft spectrofotometrie. Dit is ook de analyzer waar ik de komende paar weken mee ga werken. In mijn geval word er gebruik gemaakt van zichtbaar licht

Kogelmolen

(Geen U.V. licht) om monsters te analyseren. Ben eigenlijk de hele dag met de spectrofotometer bezig geweest. Eerst een water monsters verzameld en gefilterd. Het residu en de filter vervolgens geëxtraheerd met aceton. Dit doen we door een monsterflesje in een kogelmolen (zie foto links) te plaatsen en vervolgens 20 seconden heel hard te laten schudden. Hierdoor wordt het filter met de aanwezige celwanden vernietigd en gaan de pigmenten in oplossing. Deze oplossing gaat vervolgens weer in de centrifuge. De vloeibare fractie wordt tenslotte geanalyseerd met de spectrometer. Dit gaat als volgt.
Een quarts kuvet wordt gevuld met de te analyseren oplossing en vervolgens wordt er een lichtstraal doorheen geleid. Doordat pigmenten licht opnemen, zal de intensiteit van het licht afnemen (op specifieke golflengte). Deze afnamen is een maat voor de concentratie van bijvoorbeeld chlorofyl-a.

Woensdag 3 September 2014 8:30-16:30

De dag begonnen met het verzamelen van watermonsters uit de schelde. Dit keer een groot monster van 1 Liter i.p.v. 10 maal 1 Liter. Dit vanwege uiteenlopende resultaten voorgaande dag. De monsters voorbereid voor analyse, filteren – vernietigen – centrifugeren en tenslotte analyseren. Voordat ik kon gaan analyseren moest eerst een blanco meting worden gedaan. Uiteindelijk net voor de pauze de analyses afgerond en daarna even opgeruimd. Zo alles weer netjes en nu??? Mijn begeleider had de rest van de dag vrij, dus kreeg ik een andere opdracht. Filters inwegen. Best saai klusje maar moest toch gebeuren. De filters worden gebruikt op onderzoeksschepen, weging is alleen niet mogelijk op zee vandaar dat het op het lab gebeurt.

Donderdag 4 September 2014

Eerst wat administratie moest namelijk even op collega wachten. Rond 9 ben ik in opdracht van Lennart (begeleider van andere afdeling) slib monsters gaan zeven. Een extern bedrijf wil graag weten wat de korrelgrootte is. Na het zeven, verzonden voor voorbehandeling. Na de middag ben ik de zandmonsters die vorige week op het wad zijn verzameld gaan zeven. Dit was best een taai klusje het waren namelijk 2 specie kuipen vol. Later word aan dit zand een kleurstof toegevoegd, vervolgens wordt het teruggebracht naar plaats van herkomst. Doordat de kleurstof is toegevoegd is het mogelijk om te zien waar het zand blijft, naartoe spoelt.

Vrijdag 5 September 2014

Door ziekte geveld.

Leerpunten: Haast en spoed zijn zelden goed. Moet er op letten dat ik rustig te werk ga kwaliteit staat ver boven kwantiteit.

Hieronder nog wat foto's.

Monster voor extractie.

Monster na extractie.

Gezeefde zand monsters.

Eerste week Nioz

Nioz

Mijn naam is Stef Roodenburg en volg de opleiding Green Engineering aan het Helicon in Boxtel. Dit is mijn 3^de leerjaar, dit leerjaar begon met een stage periode van 10 weken. Het stage bedrijf heet het Nioz. Het NIOZ Koninklijk Nederlands Instituut voor Onderzoek der Zee is het oceanografische instituut voor Nederland. Het instituut verricht zowel fundamenteel als toegepast wetenschappelijk onderzoek om kennis te verzamelen over estuaria, zeeën en oceanen. Het instituut ondersteunt het onderzoek en onderwijs in de mariene wetenschappen in Nederland en in Europa.

Gedurende mijn stage periode zal ik een blog bijhouden wat mijn ervaringen zijn. Veel lees plezier, Originele tekst was langer maar heb hier en daar wat geschrapt vanwege de leesbaarheid.

Maandag 25 augustus 2014.       8:00-16:00

De Titrino

Mijn eerste stage dag bij het Nioz. Na het nodige papierwerk en een rondleiding over het terrein en alle faciliteiten. Ben ik aan de gang gegaan in het lab onder begeleiding van Jan Sinke. Aangezien dat ik alleen wat basis lab ervaring heb zijn we begonnen met de correcte gebruikswijze van een pipet. Tijdens het oefen hebben we meteen monsters klaargemaakt voor analyse. Na het oefen met pipeteren mocht ik aan de gang met de 702 SM Titrino van Metrohm. Deze machine wordt gebruikt om titraties geautomatiseerd uit te voeren. Voordat je ermee kan werken moet deze eerst gekalibreerd worden dit doe je door de titer instelling aan te passen. De precieze kwaliteit en molariteit van de titreer vloeistof kan veranderen naarmate het langer bewaard word. Om dit te achterhalen voer je 3 titraties uit en neem je het gemiddelde daarvan dit voer je vervolgens door in de software (Tiamo 2.3, met dit programma wordt het Titrino apparaat uitgelezen. Toen de titer was bepaald mocht ik de monsters die ik in de ochtend had gemaakt gaan analyseren. Deze hadden enige tijd gestaan en waren klaar voor analyse. Heb uiteindelijk 4 monsters geanalyseerd (fles nr. 97, 98, 99 en 100). Aan het einde van de dag was er nog wat tijd over en heb ik een aantal monsters klaargezet zodat ik de volgende dag meteen aan de gang kon.

Dinsdag 26 augustus 2014.          8:30-16:30

Dag twee begon slecht, ofja het weer zat niet mee, de hele dag regen regen en nog eens regen. Uiteindelijk met een nat pak en iets later dan gepland toch aan de gang. Ik ben begonnen met het uitvoeren van de analyses van de monsters die ik de vorige dag had klaargezet. Tijdens het klaar maken van een van de monsters werd ik op mijn vingers getikt vanwege mijn nogal onjuiste manier van overhevelen. Nadat Jan me uitgelegd had hoe het veilig gebeurt kon ik weer verder. De oplossing die gebruikt wordt om te titreren was op, Er moest dus nieuwe gemaakt worden. Het betrof een oplossing die 10x verdunt diende te worden. Dit ging goed (bedankt Paul voor de uitleg over concentratie en mengverhouding, het is blijven hangen) Nadat deze oplossing gemaakt was moest de Titrino opnieuw gekalibreerd worden. Dit is nodig omdat je eigenlijk nooit exact een oplossing kunt maken, je hebt altijd te maken met meetfouten, de afwijking moet dus bepaald worden anders kloppen je resultaten niet. Na het kalibratie proces kon ik weer verder met de monsters. Ditmaal waren het monsters zeewater andere hoeveelheid zuurstof dus. Uit de analyses kwamen nogal afwijkende waardes. Ze vielen een factor 10 te laag uit. Toen Jan dit zag zei hij 'dit kan eigenlijk niet, dit zou betekenen dat er nagenoeg geen zuurstof in het water zat. Kreeg de opdracht om het nog een keer handmatig uit te rekenen. Zo gezegd zo gedaan, de uitkomsten kwamen overeen. Heb Jan erbij geroepen en na wat zoeken in het programma van de Titrino kwamen we er achter dat we een nul te veel hadden ingevuld achter de komma. Na correctie bleek alles in orde en kon ik weer verder. Er werd me gevraagd mijn resultaten aan Marco (lab verantwoordelijke) te presenteren. Het was een blaadje met gemeten waardes, de standaard afwijking en de spreiding in %, deze was onder de 1% en dit is een acceptabele afwijking. Het rapport was alleen niet compleet er ontbraken nog een aantal dingen. Er stond geen berekening bij, het apparaat type en de gebruikte methode, moet beter dus. Ook in de loop van de stage voor mezelf een beschrijving maken hoe het apparaat werkt (meetrapport?) Aan het einde van de dag heb ik nog 4 zuurstof analyses uitgevoerd onder toezicht van Jan, daarna opruimen en afsluiten.

Woensdag 27 augustus 2014.    8:30-16:00

Analyzer voor opgeloste koolstof

s'Morgens eerst met Jan aan de gang gegaan met een analyzer die de hoeveelheid opgelost organische koolstof bepaald. (foto) Voordat de analyzer dit kan doen zijn er een aantal ongewenste elementen die uit het monster verwijdert moeten worden. Bijvoorbeeld koolzuurgas, je weet wel die belletje in je cola. Na een korte uitleg van de werking van het apparaat mocht ik meehelpen met monsters invoeren. Ik moest wel handschoenen dragen voor mijn eigen veiligheid, maar ook omdat ik een roker ben: de teerdampen en koolstof van de rook zitten aan je handen en beïnvloeden de meting. Zeer gevoelig instrument dus. De analyses nemen redelijk wat tijd in beslag. Dus eest gepauzeerd en toen weer verder. Voordat de monsters geanalyseerd kunnen worden moet de analyzer eerst gekalibreerd worden en gecontroleerd worden aan de hand van controlemonsters. Dit doe je door monsters te analyseren waarvan de waarde bekend is, vallen de uitslagen binnen een bepaalde waarde dan is het goed en kunnen de echte monsters worden ingevoerd. Ook tussen de monsters door word nog regelmatig een controle uitgevoerd zodat ze zeker zijn van de resultaten. De laatste paar uur ben ik bezig geweest met het uitspitten van de berekening en het principe van de Titrino. Een gedeelte lukte wel alleen ik kwam er niet uit. s'Avonds nog een poging gewaagd maar het lukte niet, dan maar te bed meer slapen helpt meestal wel.

Donderdag 28 augustus 2014.   8:30-16:15

Wadlopen

Ben in de ochtend verder gegaan met de berekening van de Titrino O₂ analyse (kwam al een stuk verder dan de dag daarvoor) omdat ik moest wachten totdat de buitendienst klaar was voor vertrek. Om ongeveer 9:30 kwam Lennart me ophalen om te gaan. Onze missie zand halen op het wad locatie De Oesterdam bij Bergen op Zoom. Klinkt simpel en dat was het ook alleen nogal arbeidsintensief. De precieze plek waar we moesten zijn bleek een meter of 70 uit de kust te liggen. Huh? dat is toch zee. Jup. Daar kun je dus allen komen als het eb is dan staat het water op zijn laagst. Wat dan 'droog komt te liggen heet wad, en dat is een redelijk grote oppervlakte, iig een groter gebied dan ik had verwacht. (Zal een keer een foto maken van hoogtij en laagtij in Yerseke dan kun je zien om hoeveel water het gaat, zal het precies meten maar het is echt wel een meter of 2 verschil) Op locatie was het even flink sjouwen. We moesten steeds met 2 emmers een meter of 70 lopen over het wad en dan nog de dijk op om het in de aanhanger te gooien. Dus dat was even aanpoten. Toen de eerste aanhanger gevuld was is Lennart terug gereden naar Yerseke om te lossen. Ik ben samen met een collega op het wad gebleven om een inventarisatie te maken. Dit houd in dat je een raster maakt van 1 m² vervolgens ga je tellen hoeveel er van een bepaalde soort voorkomt. Dit wordt genoteerd samen met de geschatte grote. 

inventariseren 

De inventarisatie plekken moeten zo random mogelijk zijn om een betrouwbaar en realistisch beeld te krijgen van de situatie. De manier die wij hadden toegepast is met je rug naar het inventarisatie gebied gaan staan en een schep over je schouder werpen. Daar waar de schep land zet je een 1 m² uit en ga je tellen. Toen Lennart terug was met de auto hebben we nog een lading zand geladen. Daarna zijn we nog een eind het wad opgelopen. Hij wilde graag even gaan kijken bij een aantal locaties. Deze locaties zijn enige tijd geleden opgezet en Lennart was benieuwd hoe het er nu bijlag. Niet goed. Eigenlijk erg jammer maar ongeveer de helft van de locaties was beschadigd, waarschijnlijk vandalisme. Toen terug naar de auto om weer naar het Nioz te gaan. Was overigens nog wel een stukje lopen over het wad voordat we bij de auto waren. Op de terugweg en tijdens het wadlopen nog wat dingen gevraagd over het wad en de dijk, eb en vloed enz. Bij aankomst hebben we eerst de wagen gelost. En zijn we pauze gaan houden want die hadden we overgeslagen. De laatste paar uur heb ik nog wat zuurstof analyses uitgevoerd onder half toeziend oog van Jan. Begin er al handigheid in te krijgen, alleen de berekening van de O2 ...daar kom ik alleen niet uit en dus zal ik uitleg vragen aan mijn stagebegeleider.

Vrijdag 29 augustus 2014. 8:30-14:30

Vrijdag ben ik bezig geweest met verslaglegging en het typen van mijn blog. En jawel hoor...ik weet nu hoe de O2 berekening werkt!

Het principe is een redox-titratie waarbij de aanwezige zuurstof in het monster (flesje water) via toevoeging van reagentia (Mn Cl2, NaOH-KJ) en later zuur, wordt getitreerd met een gestelde thiosulfaat oplossing. Hierbij geldt:

1mol O₂ –> 4 mol Mn(OH)₃ –> 2 mol I₂ –> 2 mol I₃-

2 I₃^- + 4 S₂O₃²¯ < - > 6 I^- + 2 S₄O₆²¯

Dus 1 mol O₂ gebruikt 4 mol titrant S₂O₃. De uiteindelijke formule wordt dan:

Zuurstof mg O₂/liter = ((EP1-C38)*C30*CO1*CO2) / (COO-C22)              

COO      : Volume fles

CO1       : 32      molmassa O₂

CO2       : 1 mol O₂ à 4 mol S₂O₃

                   : 250 Van mol/liter  naar mmol/liter  *1000/4

C22        : Volume toegevoegde chemicalien NaOH-KJ en MnCl₂

C30        : Titer uit de Winkler T formule

Eigen kantoor

C38        : uitkomst van de blanco

Zonsopkomst eerste werkdag

Eigen kantoor